基苗床是花卉生长的物质基础，除具备富含腐殖质、营养成分及土壤疏松通气、蓄水保肥的特性外,还必须无病虫源。因此苗床及花卉培养土要定期进行消毒灭菌。常用的苗床消毒法有高温消毒和药剂消毒两种。
高温消毒是通过提高苗床土壤温度进行杀毒。秋季正值大棚花卉育苗时机。为提高育苗质量,在育苗前,应选晴天进行苗床消毒。方法是深挖苗床,深度为15厘米～20厘米,晾晒2天～3天,如铺设黑色塑料地膜,则效果更佳,可使苗床温度达到50℃以上,进而杀死土中的害虫、病菌孢子和线虫。
药剂消毒是使用药物杀死土壤中的害虫及病原菌。按使用的药物种类和消毒方式的不同,大致分以下几种。
①杀毒矾毒土法。每平方米用10克64%杀毒矾拌细土10公斤撒在苗床土壤中,半个月后再整地。
②多菌灵毒土法。每平方米用50%多菌灵10克与干细土拌匀,在播种前将1/3药土撒在苗床上作垫土,将种子播在上面后,再将剩下的2/3药土作覆土。撒后在土壤表面适量洒水,保持土壤湿润,以免过干产生药害。
③敌百虫毒土法。为防止种子出苗后遭受蝼蛄、蚯蚓等危害,在填营养土之前,每平方米苗床可用2.5%敌百虫粉4克～5克,加细土0.5公斤～1公斤拌匀后,撒入苗床消灭地下害虫。
④高锰酸钾消毒法。苗床在翻土做床整地后,使用0.1%～0.5%高锰酸钾溶液喷洒浇透,用薄膜盖闷床土2天～3天,揭膜后让苗床稍微晾干些再进行播种或扦插。此法能有效地杀死床土中的病菌,防止立枯病、腐烂病等。
⑤福尔马林消毒法。在扦插或播种前15天,将苗床耕松,每平方米用福尔马林50毫升兑水5公斤混匀后喷在苗床上,然后用旧麻袋或薄膜盖4天～6天。也可将福尔马林加水配成100倍液,每公斤福尔马林液可混合4吨～5吨营养土,将营养土拌好,用膜严实封住,可杀死土壤内的病菌。2天～3天后揭去膜,晾晒8天～10天,使土壤中的药散发后再填入苗床。
⑥多菌灵溶液消毒法。将50%多菌灵配成1000倍液,按1000公斤营养土加50克～60克多菌灵的用量喷洒,喷后将其拌匀,用膜密封2天～3天,可杀死土壤中的多种病菌。
⑦敌克松消毒法。用95%敌克松200倍～400倍液直接喷洒苗床后进行扦插或播种。

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