透骨草是多年生草本植物，高（10-）30-80 (-100）厘米。茎直立，4棱形，不分枝或于上部有带花序的分枝，分枝叉开，绿色或淡紫色，遍布倒生短柔毛或于茎上部有开展的短柔毛，少数近无毛。叶对生；叶片卵状长圆形、卵状披针形、卵状椭圆形至卵状三角形或宽卵形，草质，长（1-）3-11（-16）厘米，宽（1-）2-8厘米，先端渐尖、尾状急尖或急尖，稀近圆形，基部楔形、圆形或截形，中、下部叶基部常下延，边缘有 (3-）5至多数钝锯齿、圆齿或圆齿状牙齿，两面散生但沿脉被较密的短柔毛；侧脉每侧4-6条；叶柄长0.5-4厘米，被短柔毛，有时上部叶柄*短或无柄。 [2]

穗状花序生茎顶及侧枝顶端，被微柔毛或短柔毛；花序梗长3-20厘米；花序轴纤细，长（5-）10-30厘米；苞片钻形至线形，长1-2.5毫米；小苞片2，生于花梗基部，与苞片同形但较小，长0.5-2毫米。花通常多数，疏离，出自苞腋，在序轴上对生或于下部互生，具短梗，于蕾期直立，开放时斜展至平展，花后反折。花萼筒状，有5纵棱，外面常有微柔毛，内面无毛，萼齿直立；花期萼筒长2.5-3.2毫米；上方萼齿3，钻形，长1.2-2.3毫米，先端多少钩状，下方萼齿2，三角形，长约0.3毫米。 [2]

花冠漏斗状筒形，长6.5-7.5毫米，蓝紫色、淡红色至白色，外面无毛，内面于筒部远轴面被短柔毛；筒部长4-4.5毫米，口部直径约1.5毫米，基部上方直径约0.7毫米；檐部2唇形，上唇直立，长1.3-2毫米，先端2浅裂，下唇平伸，长2.5-3毫米，3浅裂，中央裂片较大。雄蕊4，着生于冠筒内面基部上方2.5-3毫米处，无毛；花丝狭线形，长1.5-1.8毫米，远轴2枚较长；花药肾状圆形，长0.3-0.4毫米，宽约0.5毫米。雌蕊无毛；子房斜长圆状披针形，长1.9-2.2毫米；花柱细长，长3-3.5毫米；柱头2唇形，下唇较长，长圆形。

瘦果狭椭圆形，包藏于棒状宿存花萼内，反折并贴近花序轴，萼筒长4.5-6毫米，上方3萼齿长1.2-2.3毫米。种子1，基生，种皮薄膜质，与果皮合生。花期6-10月，果期8-12月。 [2]

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